Goya a reçu plusieurs récompenses. Celui de la meilleure lumière décernée au chef opérateur Vittorio Storaro lors des European Film Awards en 2000 et celui de la meilleure contribution artistique et du prix du jury oecuménique à Montréal en 1999. Le film a également remporté les Goya de la meilleure lumière, meilleur maquillage et meilleur production en Espagne en l'an 2000.
Carlos Saura a confié le rôle de Goya, son peintre préféré, à Francisco Rabal, décédé au mois d'août de l'année 2001. C'était un monstre sacré du cinéma très populaire en Espagne. Il avait déjà collaboré avec Carlos Saura à l'occasion des Bandits en 1963. Son interprétation de Goya lui a valu un prix dans son pays natal qui se trouve être, un Goya (!).