Mia est une jeune mère veuve. Son fils Scotty est dans un fauteuil roulant à la suite d'un accident. Mia travaille dans une boutique qui vend des chapeaux de Noël, mais la crise rend l'avenir de la boutique incertain.
Napoleon Dynamite, nerd associal complètement à l'ouest, traverse l'année scolaire dans une indifférence totale. Jusqu'à que son ami Pedro, étudiant mexicain tout aussi impopulaire que lui, décide de devenir délégué des élèves...