Doctor Who (2005) > Saison 6

Trois enveloppes bleues comme le TARDIS, numérotées 2, 3 et 4, sont envoyées au Docteur, à River Song ainsi qu'au couple Amy et Rory. Chacune contient une date, une heure et une référence géographique. Tous les quatre suivent respectivement les indications. Ils se retrouvent réunis au milieu du désert de l'Utah. Mais cette étrange convocation est l'occasion de révéler un terrible secret à Amy, Rory et River Song qu'ils ne doivent absolument pas dévoiler au Docteur. Celui-ci décide de partir à la recherche du destinataire de la quatrième enveloppe. Son enquête entraîne le Docteur et son équipe dans le bureau ovale de Richard Nixon...

Le Docteur se cache dans une sorte de cellule parfaite où il peut rester et embarquer à bord du TARDIS sans être vu ou entendu. Quant à Amy, Rory et River Song, ils sont poursuivis à travers les Etats-Unis par le FBI. Canton Everett Delaware III, un nouvel ami, leur vient en aide. L'équipe doit lutter impérativement contre les «Silents», une force extraterrestre contrôlant la Terre. Le Docteur décide de préparer une révolution pour chasser cet ennemi et retrouver une étrange petite fille disparue. Le président Richard Nixon se met à collaborer à ses côtés. Mais Amy se fait enlever par les «Silents»...

Le Docteur, Amy et Rory sont à bord du Tardis. Ils reçoivent un appel de détresse du XVIIe siècle. Ils décident de porter secours à ces personnes. Les trois amis se retrouvent sur le bateau pirate du capitaine Avery qui est attaqué par une sirène. Avec ses chants, elle attire les marins pour ensuite les faire disparaître. Le Docteur demande aux matelots de se réfugier dans la poudrière. Ils découvrent ensemble le fils du capitaine Avery, Toby, qui a embarqué sans le dire à son père. Enfermé, l'équipage est victime de claustrophobie. Le Docteur cherche à comprendre ce qui se cache derrière ces peurs...

En voyage au fin fond de l'espace, le Docteur détecte un signal de détresse d'un Seigneur du Temps. Il décide de se diriger vers cet appel. Le Docteur débarque finalement avec Amy et Rory sur une planète dépotoir, installée sur un étrange astéroïde, dans un univers Bulle. L'équipe découvre alors une surprenante famille composée de deux humains et un Ood : Tantine, Tonton et Neveu. Le Docteur rencontre aussi l'énigmatique Idris. Interloqué, il mène l'enquête en laissant Amy et Rory enfermés dans le Tardis. Le Docteur finit par comprendre qu'avec ses amis, ils sont en danger. Cet appel est un leurre pour piéger les Seigneurs du Temps...

Le Docteur cherche à comprendre les résultats du TARDIS sur l'éventuelle grossesse d'Amy. Le vaisseau se retrouve emporté dans un tsunami solaire. Le Docteur, Amy et Rory se posent alors sur la Terre au XXIIe siècle. Les trois compagnons d'aventure découvrent avec effroi, sur une île, une catastrophe industrielle. En effet, une entreprise emploie des clones, les Gangers, pour effectuer des opérations très dangereuses. Mais suite à un accident, ces clones prennent la forme de ceux qui les contrôlent. Le Docteur rencontre la responsable de l'usine, Miranda Cleaves, en se faisant passer pour un inspecteur. Elle refuse de fermer le site...

Le tsunami solaire progresse sur l'île. Le Ganger de Jennifer tente de monter une rébellion avec les autres clones. Ces créatures sont prêtes à s'affronter avec les humains. Le Docteur essaye de calmer la situation, mais sa tâche se complique avec l'apparition de son clone. Amy ne sait plus si elle peut faire confiance au Docteur ou si elle parle à son clone. Quant aux humains appelés les «Authentiques», ils attendent avec impatience une navette pour évacuer vers le continent. Le Docteur espère les convaincre de collaborer avec leurs Gangers pour faire tomber le monstre qu'ils ont finalement inventé...

Amy, la femme de Rory, a été enlevée. Elle se retrouve emprisonnée dans une base astéroïde nommée Demon's Run. Elle pense retrouver sa fille, Melody, enlevée par Madame Kovarian. Le Docteur et Rory décident de rassembler une armée pour porter secours à Amy et découvrir où se cache Melody. Pour y arriver, ils tentent de recruter River Song dans sa prison de Stormcage. Cette dernière refuse en arguant au Docteur que sa véritable identité va être révélée au cours de cette bataille. Rory et le Docteur traversent finalement les galaxies, sans River Song. Un terrible affrontement s'engage contre Madame Kovarian et l'ordre des Moines sans Tête...