Fanny Cottençon a intègré la Rue Blanche avant d'enchaîner les rôles de jeunes premières dans des pièces classiques. Elle aborde le cinéma avec Signé Furax (1980) et enchaîne les petits rôles à la fin des années 70 sans vraiment percer.
Fanny Cottençon s'est quelque peu éclipsée du grand écran au début des années 90 pour revenir en force en 2001 avec trois films dont celui de Liria BegejaChange-moi ma vie. Compagne de Roger Coggio, Fanny Cottençon a été aussi sa partenaire et actrice dans Le Mariage de Figaro en 1989. Elle continue de jouer beaucoup pour la télévision et le théâtre où elle a interprété avec succès Les Monologues du Vagin de Eve Ensler.