La Chambre du fils est certainement le film le plus personnel de Nanni Moretti, et pourtant il ne parle pas de lui. Très pudiquement, le réalisateur évoque un fait très simple, mais cruellement douloureux : la mort d'un enfant. Face à cette fatalité, chaque membre de la famille va réagir différemment, et la distance va s'installer entre eux, pourtant si unis. "Je voulais montrer la douleur qui sépare des gens qui s'aiment", explique le réalisateur.
Giovanni, psychiatre, vit avec sa famille à Ancône : sa femme Paola, sa fille Irene, et son fils Andrea. La famille vit heureuse, sans trouble apparent. Giovanni est un peu trop exigeant avec Andrea, qu'il aimerait à son image, mais les relations familiales sont sans nuages. Un dimanche, Giovanni est appelé en urgence par un patient névrosé. Il se rend à son domicile, au lieu d'aller courir avec son fils. Andrea part alors faire de la plongée. Mais il ne reviendra pas. La perte de cet être cher va bouleverser l'équilibre familial. (