L'ambiance très particulière de Rozen Maiden a sans conteste été profondément influencée par l'univers littéraire et artistique de Lewis Carroll, l'auteur d'Alice aux pays des merveilles. Du miroir qui sert de portail menant à un univers parallèle au démon Laplace, on y retrouve plusieurs thèmes empruntés à Alice et sa suite De l'autre côté du miroir.
Les Rozen Maiden sont des poupées créées par un mystérieux artisan du nom de Rozen et qui prennent vie lorsqu'on les remonte. Avec chaque poupée, Rozen a tenté de fabriquer la petite fille parfaite, mais il a échoué à 7 reprises et a fini par renoncer. Toutes ces poupées sont d'une extraordinaire beauté et sont vêtues de costumes datant de l'époque victorienne.
La Rosa Mystica est l'essence même, l'âme d'une Rozen Maiden, ce qui lui permet de s'animer et de parler. Lorsqu'une poupée est vaincue dans un duel du Jeu d'Alice, le fragment de Rosa Mystica qu'elle contient est éjecté de son corps et est absorbé par la poupée victorieuse, qui possède alors les pouvoirs et les souvenirs de la vaincue. Selon la légende, la poupée qui rassemblera les 7 fragments de la Rosa Mystica originale deviendra Alice, la fille parfaite.