Trent et son équipe emploient certaines des méthodes les plus risquées qu'ils aient jamais essayées pour faire tomber la racaille terroriste de San Diegan, notamment en échangeant de visages les uns avec les autres, en kidnappant un extraterrestre, en simulant leur propre mort, en décryogénisant un ancien radical des années 1960, etc...
Trent se bat pour reprendre le contrôle d’un avion détourné rempli de prisonniers arrêtés au Comic-Con.
S03E02 - P***** de discours
Le président de la Marine doit prononcer un discours lors d'une remise de diplômes mais il ne peut s'empêcher de jurer. Pendant ce temps, les agents Trent et Alphonse sont de retour de leurs missions d'infiltration mais agissent étrangement.
S03E03 - Extraterroristre
Le neveu de Trent héberge un extraterrestre apparemment pacifique, mais la NTSF sait bien qu’aucun alien n’est gentil.
S03E04 - Burn After Killing
S03E05 - Burn after Killing
Le petit livre noir de Kove a été volé et le seul agent de la NTSF assez doué pour l’aider est mort. Ou pas.
S03E06 - Trois femmes et un train
Trent raconte comment les trois Anges du temps, une unité antiterroriste féminine, ont remonté le temps jusqu'à l'époque du Far West pour arrêter un méchant et aider le président Grant à ouvrir le chemin de fer transcontinental américain.
S03E07 - Un disque dur à avaler
Lorsque la couverture du robot S.A.M. est découverte lors de l'infiltration d'un groupe haineux anti-robots, il est fait prisonnier. L'équipe NTSF se fait passer pour une équipe de tournage d'une vidéo virale afin de le sauver mais est distraite.
S03E08 - Le prisonnier décongelé
Un ex-agent de la NTSF macho de 1963 est appelé en renfort pour arrêter son ancien ennemi hippie.
S03E09 - Échange de visages
Pour Trent et Sam, échanger de visages pour piéger un terroriste est facile, reprendre le sien, plus difficile.
S03E10 - U-KO
La NTSF doit empêcher l'assassinat du Premier ministre de la Royal Navy d'une petite enclave, très stéréotypée britannique, près de San Diego, qui est sur le point de devenir une partie de la ville. La version britannique du NTSF est là pour aider.
S03E11 - Comment Piper a trouvé son style
Avant de devenir un agent super sexy, Piper était une étudiante bizarre fan de combinaisons en vinyle.
S03E12 - Noël au centre commercial
Les enfants de Trent comprennent le véritable sens de Noël quand un terroriste déguisé en Père Noël attaque le centre commercial. Il les piège à l'intérieur. L'équipe est désespérée de pouvoir entrer et continuer à acheter des cadeaux.