Le CCG, une organisation gouvernementale chargée d'étudier et d'éradiquer les goules, met sur pied un nouveau groupe composé de sujets expérimentaux : les "Quinx". Dirigé par l'inspecteur Haise Sasaki, ce groupe atypique se voit confier une mission tout aussi singulière.
Il y a dix ans, un groupe de Chevaliers Sacrés renégats appelé les Seven Deadly Sins s'est rebellé contre les Chevaliers Sacrés, la garde du royaume. Depuis, ils ont disparu et personne ne sait ce qu'ils sont devenus. Mais selon la rumeur, ils seraient toujours vivants, quelque part...
Sora et Shiro, frère et soeur, forment la meilleure équipe de jeu en ligne du monde : Blank. Lorsqu'ils parviennent à battre un dieu à un partie d'échec, ils sont envoyés dans un monde parallèle, où tous les conflits sont résolus par des jeux...
Yato est un dieu qui rêve de devenir la divinité la plus vénérée du pays. Pour ce faire, il exauce n'importe quelle demande contre une rémunération de 5 yens. Au cours de l'une de ses missions, il manque de se faire écraser par un bus qu'il évite grâce à une lycéenne, Hiyori Iki qui voit alors son âme se séparer de son corps.
Tatsumi, naïf, se fait dérober tout ce qu'il possède par une mystérieuse jeune fille alors qu'il allait sauver son village. Heureusement, une autre jeune fille propose de l'accueillir chez elle. Cependant, un groupe d'assassins débarque pour s'en prendre à sa protectrice...
Yona, jeune princesse, mène une vie de rêve. Elle rêve de pouvoir unir sa vie à Soo-Won, son cousin dont elle est secrètement amoureuse. À l'approche de ses 16 ans, tous se préparent à fêter comme il se doit son anniversaire. Mais ce soir-là, une terrible tragédie survient et la vie de Yona va être bouleversée à jamais !