Peter Parker a enfin réussi à concilier son amour pour Mary-Jane et ses devoirs de super-héros. Mais l'horizon s'obscurcit. La brutale mutation de son costume, qui devient noir, décuple ses pouvoirs et transforme également sa personnalité...
Ben, Kara et Henry sont les pilotes d'essai d'avions de combat furtifs ultrasophistiqués. EDI, un avion de combat à intelligence artificielle sans pilote humain, va échapper à leur contrôle avec le risque de déclencher une guerre nucléaire...
Deux ans après avoir combattu le Bouffon Vert, Spider-Man, nouveau justicier new-yorkais tourmenté par son lourd secret, poursuit sa lutte contre le crime. L'homme-araignée est opposé à un redoutable ennemi : le docteur Octopus.