Alors que leurs proches succombent au Sida les uns après les autres, un groupe d'amis décide de voler les médicaments dont ils ont besoin et de les distribuer au sein de leur communauté.
Un jeune homme, âgé d’à peine vingt ans, cherche désespérément à sortir de l’enfer de la drogue en devenant serveur dans un restaurant de Londres. Mais pour ce faire, il doit trouver une paire de chaussures convenable, chose que ses vagabondages de sans-abri ne lui ont pas permis d’acquérir.
Inspire par les souvenirs d'enfance de Nils Malmros, "l'Arbre de la connaissance" est la reconstitution minutieuse de la vie scolaire pendant les annees 1958-1960.