A l'âge de dix ans, James Wong quitte Hong Kong pour immigrer avec sa famille aux Etats-Unis. C'est au lycée El Cajon de San Diego qu'il fait la rencontre de son fidèle ami Glen Morgan avec qui il coécrit de nombreux scénarios. Passionnés de cinéma et de télévision, ils intègrent une troupe d'improvisation théâtrale à La Jolla, en Californie, avant de poursuivre des études en communication à la Loyola Marymount University.

En 1986, James Wong et Glen Morgan rédigent leur premier script pour le cinéma, celui de The Boys next door, un film policier de Penelope Spheeris avec Charlie Sheen. Mais c'est pour le petit écran qu'ils sont les plus actifs : ils écrivent de nombreux épisodes des séries télévisées 21 Jump Street (1987), Booker (1989), Space 2063 (1995), Millennium (1996) dont ils sont les producteurs exécutifs, et The Others (2000). Tous deux obtiennent des citations à l'Emmy Award en 1995 ainsi qu'un Golden Globe en 1996 pour leur travail sur la série X-files.

Fort de ce succès, James Wong décide de passer à la réalisation en mettant en scène le film fantastique Destination finale (2000) et le long métrage de science-fiction The One (2001) dont il a coécrit les scénarios avec Glen Morgan.