Après avoir décrôché un diplôme de dessin animé et de cinéma à la School of Visual Arts, John Eng devient directeur artistique pour la société Image factory, spécialisée dans la production de spots, logos et génériques animés. Il se rend ensuite à Los Angeles où il fonde sa propre société d'animation, Icon Red Inc.

John Eng travaille ensuite comme dessinateur conceptuel sur les séries animées Max Headroom et Duckman puis devient créateur de création pour la célèbre firme de dessins animés Hannah Barbera. Pour la maison de production Klasky Csupo, il est, en 2000, réalisateur de séquences sur Les Razmoket à Paris, le film. Deux ans plus tard, il co-réalise Les Razmoket rencontrent les Delajungle avec Norton Virgien.