Qui est cette juge d’instruction qui donne tant aux autres, qui se consacre entièrement à l’idée qu’elle se fait de la justice, et qui semble bien seule ? "Marianne" est avant tout un portrait de femme : celui de Marianne Vauban, juge d’instruction à Toulon, peu orthodoxe, au franc-parler surprenant, aux méthodes peu conventionnelles, mais à l’humanité certaine et rayonnante.
En pleine quête d'identité intime, Hicham Alaoui, 22 ans, décide brusquement de s’enfuir de chez lui. Désertant sa famille qui ne soupçonne rien, il se rend à Lyon, à la rencontre de Thibaut Giaccherini, un militant pour les droits LGBT qu'il admire pour sa force et son affirmation de soi.