Une organisation autoritaire et oppressive menace de conquérir le monde. Des scientifiques relevant de l'armée sont réunis afin de mettre au point une machine dévastatrice afin de renverser le rapport de force. Ils doivent être prêt à tout sacrifier pour sauver le monde...
Aries Spring, étudiante, est sélectionnée pour participer à un camp scolaire sur la planète McPa. Mais le jour J, elle et les huit autres participants sont projetés à des milliers d'années-lumière de leur point de départ.
Au 21e siècle, alors que leur existence avait toujours été cachée, surgissent de l'ombre des animaux anthropomorphiques. Michiru, une jeune humaine, se transforme un jour en tanuki : choquée par sa nouvelle forme, elle se réfugie à Anima City. Là, elle fait la rencontre de Shirou, un homme-loup qui dit détester les humains.
Au sein de la division des crimes non identifiés de Tokyo, une femme excentrique et un ex-agent du RAID s'attaquent à des criminels aux capacités surnaturelles.
Amate Yuzuriha, une lycéenne vivant paisiblement dans une colonie spatiale, est impliquée dans des duels illégaux de mobile suits appelés "Clan Battle". Amate y pilote GQuuuuuuX et se fait appeler Machu. Lors de ces compétitions, elle rencontre une réfugiée de guerre, Nyaan. Un jour, un mobile suit non-identifié de type Gundam apparait dans la colonie, il est traqué à la fois par la Space Force et la police.
Lorsqu'il s'éveille de son sommeil cryogénique, Akira Himegami découvre un monde bien différent du sien ; la société dans laquelle il a grandi n'existe plus, la guerre fait rage et l'organisation OWEL règne sur le monde.
An 2307, les énergies fossiles ont été épuisées et l'humanité s'est tournée vers l'énergie solaire grâce à trois ascenseurs orbitaux de 50 000 km permettant de transmettre l'énergie solaire à trois grands blocs nationaux : l'AEU, la LRH et l'Union. Malheureusement, l'énergie produite par ces ascenseurs ne profite pas à toutes les nations, ce qui attise des conflits et en fait perdurer d'autres. Une organisation répondant au nom de « Celestial Being » émerge et annonce qu'elle utilisera désormais ses Mobile Suits Gundam pour éradiquer tous les conflits.
Poursuivis par des chasseurs de primes intergalactiques, les Critters reviennent sur Terre. Ils font la rencontre du lycéen Christopher, de ses amis et de sa famille.
Dans une société utopiste interstellaire, une guerre voit s'affronter la Culture (monde techniquement très avancé) aux Idirans, une race profondément religieuse décidée à dominer la galaxie.
Ryōta Sakamoto se retrouve coincé à l'intérieur de son jeu favoris, sur une île tropicale. Pour en échapper, il doit réunir 7 pierres, qu'il obtient en tuant d'autres personnes.