Sélectionné dans 55 festivals à travers le monde, Ils reviennent y a remporté 48 récompenses, dont le prix du public au Festival International du Film Fantastique de Bruxelles et au Paris International Fantastic Film Festival. Le film a également reçu 10 nominations aux Ariel Awards (équivalent mexicain des César) où il a reçu le prix du meilleur maquillage et celui du meilleur jeune espoir masculin pour Juan Ramón López. Ils reviennent compte parmi ses fans Stephen King, Neil Gaiman et Guillermo del Toro.
Alors que la réalisatrice préparait un film sur les cartels de drogue, elle a rencontré un politologue afin de nourrir ses recherches sur le sujet. Ce dernier a évoqué les victimes souvent oubliées des cartels : les enfants. C'est ainsi qu'Issa Lopez a décidé d'en faire le sujet d'un nouveau film et d'abandonner celui sur lequel elle travaillait.
Issa López s'est inspiré du décès de sa mère à l'âge de huit ans pour écrire Ils reviennent. Même si les circonstances étaient très éloignées de celles des enfants du film, la réalisatrice a tenu à partager ses sentiments d'alors : "cette sensation de rentrer un jour de l’école, de ne plus jamais revoir sa mère, de ne jamais avoir la chance de se dire au revoir, de ne jamais voir un corps, un cercueil… Il se passe des choses étranges, tristes et intéressantes pour la personne que tu deviens. Cela vous donne l’impression d’un fantôme qui vous suit, vous attend".
Six cents enfants ont été auditionnés pour trouver les cinq jeunes interprètes du film. Pour départager les vingt derniers sélectionnés, l'équipe a fait appel à la directrice de casting de La Cité de Dieu, Fátima Toledo.
Désireuse d'avoir un réalisme presque documentaire, la réalisatrice a pris soin de ne jamais faire lire le scénario aux jeunes acteurs et de tourner dans l'ordre chronologique : "lors de la préparation, nous avons créé l’univers, les personnages, les relations, mais ils ne savaient pas ce qui allait arriver aux personnages. Ils l’ont découvert tout au long de la réalisation. Il y a des moments où ils étaient mécontents, ils étaient sous le choc, comme fous d’apprendre ce qui allait se passer. Je voulais l’utiliser, la plupart de leurs réactions sont authentiques".