Lauréat de concours de dessin dès l'âge de sept ans, Kirk Wise entre à l'école d'animation CalArts, parrainée par Disney, dès la fin de ses études secondaires. Durant sa dernière année à CalArts, il est engagé par Disney comme animateur indépendant. En 1986, il entre définitivement chez Disney, en tant qu'animateur sur Basil, détective privé puis comme scénariste sur Oliver et compagnie.

Kirk Wise participe par la suite à la création des personnages de Bernard et Bianca au pays des kangourous et réalise La Belle et la Bete en 1991 en collaboration avec Gary Trousdale. En 1993, il est le producteur exécutif du film d'aventure L' Incroyable Voyage produit par Disney, avant de retrouve Gary Trousdale en 1996 pour la réalisation du Bossu de Notre-Dame puis en 2001 pour Atlantide, l'empire perdu, pour lequel il est également scénariste.