Jean-Christophe Averty se définissait comme un "peintre électronique", et il a signé de nombreuses mises en scène musicales pour la télévision, en usant d'effets spéciaux et d'incrustation.

Précurseur dans l'utilisation des "fonds verts" et des superpositions, il signa ainsi les portages télé remarquables de l'album Melody Nelson de Serge Gainsbourg, Les Raisins verts ou Le songe du nuit d'été de Shakespeare. Il fut le défenseur de l'idée selon laquelle "la télévision ne doit pas véhiculer un programme, mais comme un véhicule d'expression".