Après avoir été impliquée dans un complot terroriste mondial, l’agence Mission Impossible est contrainte de cesser ses activités. Le Protocole Fantôme est mis en place : Ethan Hunt et sa nouvelle équipe doivent opérer dans le secret pour blanchir le nom de leur organisation.
En 1988, en Russie, Platon Makowski, un brillant scientifique, et ses amis abandonnent la recherche pour se lancer dans le monde des affaires. Ils emploieront tous les moyens possibles pour s'enrichir, même les plus illégaux...
En 1972 aux jeux olympiques de Munich, l’équipe de basket-ball de l’union soviétique joue la finale face à celle des états-unis. Alors que tout semble tourné en faveur des américains, les 3 dernières secondes de ce match mythique vont propulser l’équipe soviétique dans la légende du sport.