Pascal Morelli se forme aux Arts Appliqués avant de commencer sa carrière dans la bande dessinée puis dans la publicité en créant des storyboards et des dessins.

Il passe à la réalisation de films d'animation pour la télévision américaine et japonaise à la fin des années 80, travaillant notamment sur Ghostbusters ou Alf. A partir de 1989, il fait des storyboards pour des longs métrages de fiction de Philip Kaufman (Henry & June, Jimgrim and the 9 unknown, Soleil levant).

En 1992 il se lance dans la production avec le dessin animé The Specialists diffusé sur MTV. Il enchaîne ensuite les réalisations pour la Paramount (Busy world Richard Scarry) ou encore France Animation (Arsène Lupin). C'est en 1997 qu'il s'attèle à son premier long métrage d'animation tiré de l'album d'Hugo Pratt Corto Maltese en Sibérie rebaptisé Corto Maltese, la cour secrète des arcanes, qui sort en 2002.