Heike Monogatari raconte l'histoire de l'ascension et de la chute du clan Taira pendant la guerre de Genpei. L'anime se centre sur le point de vue de Biwa, une ménestrel voyageuse aveugle. Biwa rencontre Taira no Shigemori, héritier de son clan et porteur d'une vision surnaturelle lui permettant de percevoir les fantômes. Elle lui proclame alors une prophétie de la chute de son clan.
Le clan Taira, également connu sous le nom de Heike, a atteint un pouvoir et une influence sans précédent au Japon. Dans des circonstances étranges et terribles, une fillette se retrouve mêlée à leur conflit politique.
S01E02
Shigemori se précipite pour faire face aux retombées de l'assaut de Kiyomori sur le régent. Alors que Biwa passe plus de temps avec la famille de Shigemori, elle commence à se sentir à l'aise.
S01E03
Le mariage de Tokuko se poursuit même si elle est stérile, et la famille de Shigemori avec Biwa sont à Itsukushima pour superviser la cérémonie.
S01E04
Tokuko est parvenue à tomber enceinte, mais sa grossesse est compliquée. Shigemori intervient afin d'améliorer la situation, mais il ne peut que s'inquiéter de l'accroissement de l'influence de son père que cet enfant causera.
S01E05 - Bridge Battle
Go-Shirakawa tente de contre-attaquer Kiyomori. Mais celui-ci ne le supporte pas et réplique de façon très violente.
S01E06 - City Transition
Le clan Taira déménage à Fukuhara. Kiyomori y apprend que Lord Yorimoto prend les armes contre les Heike, poussé par un décret de Go-Shirakawa.
S01E07 - Kiyomori, Dies
De plus en plus de temples brûlent dans le conflit entre les Heike et les Genji. La femme de Kiyomori, Tokiko, craint que son mari n'attire la colère des dieux.
S01E08 - Leaving the Capital
Pendant que Biwa part à la recherche de sa mère, les Heike connaissent de nouveaux revers de fortune face à Yoshinaka.
S01E09 - Heike Flowing
Biwa poursuit sa route vers sa mère. Les Heike, pourchassés sans relâche par leurs ennemis, doivent fuir de refuge en abri de fortune.
S01E10 - Dan-no-ura
Shigehira connait de nombreuses défaites, tandis que l'empereur Go-Shirakawa gagne en pouvoirs contre les Heike. A ce stade, toute action risque d'être considérée comme une menace.
S01E11 - The Impermanence of Worldly Things
La bataille navale de Dan-no-ura commence par des volées de flèches tirées des deux côtés, puis les bateaux se rapprochent et se percutent.