Sawako Kuronuma rentre au lycée en se promettant une chose : se faire des amis. Mais, des tas d'obstacles se dressent entre elle et ses camarades. Mais, même si la persévérance reste son atout, en étant timide et réservée, son manque de confiance en soi ne la rapproche pas des autres. Pourtant, le jour où le garçon le plus aimable et populaire de la classe commence à lui parler, tout change alors pour Sawako.
Mikoto Misaka vit dans une ville qui accueille les étudiants pourvus de dons qu'on appelle espers.Misaka est la troisième plus puissante. Elle contrôle les champs électriques et magnétiques. Accompagnées par deux autres amies elles vont tenter de résoudre certains problèmes qui pourraient mettre en danger la cité toute entière.
Ichigo, un ado de 15 ans ayant la faculté de communiquer avec les âmes errantes, se voit assigner la mission d'affronter les "Hollows", esprits monstrueux qui se nourissent des humains et des fantômes...
Yugi est un jeune lycéen timide, secret et foncièrement gentil. Trop gentil diront certains, mais certainement pas Joey, Tristan et Téa, ses meilleurs amis. Avec eux, il partage la passion d'un jeu de cartes : Le Duel de Monstres, créé par le mystérieux Maximilion Pégasus.
Un garçon de 12 ans nommé Naota fait un jour la connaissance d'une femme mystérieuse et dérangée, montée sur une Vespa et brandissant une guitare. Avec son apparition, des choses étranges commencent à se produire autour de lui...