La carrière de Glen Morgan a été marquée par une rencontre décisive avec James Wong. Depuis l'époque du lycée El Cajon à San Diego, les deux compères ne se sont jamais séparés. Au début des années 80, ils rejoignent, tous les deux, une troupe d'improvisation théâtrale à La Jolla en Californie, où ils joueront notamment aux côtés de l'actrice Whoopi Goldberg, avant de poursuivre leurs études au sein de la filière communication de la Loyola Marymount University.

En 1983, ils coécrivent le scénario du film policier réalisé par Penelope Spheeris, De sang froid. Pendant plusieurs années, ils collaborent à plusieurs séries: 21 Jump Street, l'As de la crime, Millenium mais surtout X-Files dont ils sont coproducteurs exécutifs durant deux saisons. Cette série leur vaudra plusieurs citations à l'Emmy et un Golden Globe en 1996. Ils ont aussi créés Space 2063. En 2000, ils sont devenus scénaristes et producteurs exécutifs de la série dramatique,The Others, diffusée sur NBC.

Au cinéma, Glen Morgan a écrit les scénarios de The One en 2000 et Destination finale sorti en 2001, qu'il a aussi produits. Chaque fois, c'est son partenaire à l'écriture et à la production, James Wong, qui a réalisé. L'adaptation en 2003 du roman best seller, Ratman's Notabook de Stephen Gilbert, Willard, lui permet de faire ses débuts à la mise en scène. James Wong, qui, pour une fois, n'a pas signé le scénario, a coproduit ce film.