Stéphane Goxe est spécialisé dans le film-documentaire. Avec son confrère Christophe Coello, il co-signe Chili, dans l'ombre du jaguar en 1998, sur la résistance populaire chilienne, puis Tu n'est pas mort avec toi un an plus tard, qui donne la parole à des fils et filles de disparus, d'exilés ou de prisonniers politiques. En 2003, il co-réalise avec Christophe Coello et Pierre Carles le documentaire Attention danger travail, réflexion sur la place du travail dans la société.