Dans une première version du film, la fin montrait
Viridiana frappant à la porte de son cousin. Elle l'ouvrait, entrait puis la refermait. La censure de l'Espagne franquiste refusa cet épilogue, conduisant le cinéaste à en proposer un bien plus pernicieux selon lui, car très suggestif. Le film provoqua un scandale considérable, au Vatican notamment avec la parodie de la Cène du Christ, qui réconciliera
Buñuel avec les républicains vivant au Mexique. Palme d'Or à Cannes à titre de film espagnol, il fut aussitôt interdit en Espagne par le ministre du Tourisme et de l'Information. Le directeur général de la Cinématographie alla jusqu'à être mis à la retraite anticipée, pour être monté sur scène afin de recevoir le prix. Même si poussé à voir le film,
Franco ne lui trouva rien de blâmable, la décision du ministre fut inchangée. Lors de sa sortie à Rome, le procureur général attaqua le cinéaste en justice et le condamna à un an de prison en cas de séjour au pays; décision qui fut néanmoins levée plus tard par la Cour Suprême. Le producteur
Gustavo Alatriste dut voir le film cinq fois avant de le comprendre et le cinéaste
Vittorio De Sica interrogea la femme de
Buñuel sur la "monstruosité" de ce dernier, après la projection.