D'une mère italienne-irlandaise et d'un père juif-ukrainien, Jonathan Togo grandit à Rockland dans le Massachusetts. Diplômé du Vasser College après des études d'art dramatique, il se produit dans pas mal de spectacles dont "Subirbia", "Conduct of Life" et "Our Country's Good" pour laquel il a remporté le Margaret Thatcher Kazan Award.

En 2001, il obtient un rôle régulier dans la série fantastique Special Unit 2. Suivent des apparitions dans Amy, New York District et The Jury avant de rejoindre Les Experts : Miami à partir de la 3ème saison.

Sur le grand écran, il apparaît dans Mystic river (2003).