C’est à Bruxelles que Benjamin Egner voit le jour le 3 août 1972. Toutefois, il grandit en France, à Paris, où il attrape très vite le virus des planches. Après une formation d’acteur au Cours Florent, il intègre la troupe d’Emmanuel Demarcy-Mota dans laquelle il passe sept ans.
En 1999, il fait de la figuration dans Quai n°1 de Patrick Jamain. Il se concentre ensuite sur le théâtre jusqu’en 2005, où il joue coup sur coup dans les films Les Yeux Clairs et Un Vrai bonheur, le film.
Très vite, cependant, il abandonne le grand écran pour se concentrer sur la télévision. Après une apparition dans Boulevard du Palais en 2007, il décroche en 2008 un rôle récurrent dans la série Seconde Chance, qu’il mène pendant une saison.
Le comédien enchaîne ensuite les seconds rôles dans des séries comme Enquêtes réservées (2009), Scènes de ménages (2012) ou Lebowitz contre Lebowitz (2016), incarnant souvent des juges ou des commissaires.
La même année, il campe Stanislas Werner dans Candice Renoir avant de décrocher le rôle principal de L'Art du Crime en 2017, qu’il poursuit encore aujourd’hui. De 2019 à 2021, c’est dans la série Nina avec Annelise Hesme que Benjamin Egner se distingue. Le comédien fait quelques écarts au théâtre et dans des téléfilms, mais les séries restent son meilleur atout.
Après avoir été au casting d’HPI ou de Skam, il a joué dans la huitième saison de L’Art du Crime qui s’est achevée le 10 février 2025 et sera également à l’affiche de la saison 2 du Negociateur, prévue cette année.