Originaire de Belgique, Jonathan Zaccaï envisage d'abord d'embrasser une carrière de réalisateur, avant de finalement débuter devant la caméra. Après un passage par la publicité et quelques apparitions au cinéma (
La Révolte des enfants, 1991) et à la télévision (
Cap danger,
Sous le soleil), il campe le petit ami insatisfait de
Corinne Debonnière dans
Petite chérie (2000) d'
Anne Villaceque.
Sa carrière lancée, il balade son physique de jeune premier dans
Les Déclassés (2001) et
Reines d'un jour (id.), et s'illustre dans quelques premiers longs métrages comme
Bord de mer (2002) de
Julie Lopes-Curval et
Le Tango des Rashevski (2003) de
Sam Garbarski. Fidèle à ces deux cinéastes, il retrouve la première pour
Toi et moi (2005), comédie romantique où il a pour partenaires féminines
Marion Cotillard et
Julie Depardieu, et le second pour
Quartier lointain en 2009.
Le grand public découvre véritablement Jonathan Zaccaï aux côtés d'
Agnès Jaoui et
Karin Viard dans
Le Rôle de sa vie (2004), tandis que la critique salue sa prestation de mort-vivant au regard pénétrant dans
Les Revenants (id.) de
Robin Campillo. Valeur montante du cinéma français, il partage en 2005 avec
Hélène De Fougerolles la tête d'affiche du
Plus beau jour de ma vie, une comédie populaire sur le mariage.
Mais c'est dans un registre plus noir que l'acteur excelle. Agent immobilier escroc dans
De battre mon coeur s'est arrêté (2005) de
Jacques Audiard, il incarne le mari impuissant d'
Isabelle Carré dans le
thriller intimiste
Entre ses mains, un chômeur pour le moins louche dans
La Chambre des morts (2007) ainsi qu'un ami de longue date de
Guillaume Depardieu dans
Les Yeux bandés (2008).
On le retrouve également, toujours aussi troublant, au générique d'
Elève libre, drame de son compatriote
Joachim Lafosse présenté à la Quinzaine des Réalisateurs à Cannes et pour lequel l'acteur reçoit un Magritte du cinéma (l'équivalent belge des César). En 2010, il est choisi par
Ridley Scott pour jouer le roi de France dans
Robin des Bois, sa première incursion dans une grosse production hollywoodienne. De retour en France, il incarne le frère de
François Cluzet dans le thriller
Blanc comme neige avant d'interpréter l'amour d'enfance de
Sophie Marceau dans la comédie
L' Age de raison.
Depuis le milieu des années 2000, Jonathan Zaccaï se consacre à une nouvelle carrière, celle de réalisateur. Après deux courts métrages (
Comme James Dean et
Y'a pas de quoi), il écrit et tourne son premier long en 2012,
JC Comme Jésus Christ (dans lequel il tient également un rôle secondaire). Cette comédie inclassable suit la vie de JC (
Vincent Lacoste), un adolescent réalisateur un brin mégalo. Malgré ce passage à la mise en scène, Jonathan Zaccaï ne délaisse pas pour autant son métier d'acteur. Ainsi, il partage la même année l'affiche de
Cornouaille d'
Anne Le Ny, avec
Vanessa Paradis et
Samuel Le Bihan.