Eduard Fernández est né à El Raval, un quartier populaire de Barcelonre. Très jeune, il se passionne pour le théâtre, influencé par l’effervescence culturelle de la ville. Après avoir suivi une formation à l’Institut del Teatre, l’une des écoles d’art dramatique les plus reconnues de Catalogne, il débute sa carrière sur les planches. Il rejoint plusieurs compagnies théâtrales, dont Els Joglars et La Fura dels Baus, célèbres pour leurs mises en scène novatrices et engagées. Fernández se forge rapidement une solide réputation dans le milieu théâtral espagnol grâce à son jeu intense et instinctif.

Dans les années 1990, le jeune homme fait la transition vers le cinéma et la télévision, où il s’impose par sa capacité à donner vie à des personnages complexes et souvent torturés. Il se fait remarquer dans des films comme Les Loups de Washington de Mariano Barroso ou encore Smoking Room de Roger Gual, qui confirment son statut d’acteur talentueux. En 2000, il remporte son premier prix Goya du meilleur acteur pour son rôle troublant dans Fausto 5.0. Son style, marqué par une grande justesse émotionnelle, séduit les metteurs en scène espagnols mais pas que.

Durant les années 2000, Eduard travaille avec Pedro Almodóvar sur Etreintes brisées, Beda Docampo Feijóo sur Amores locos ou Steven Soderbergh pour Che - 2ème partie : Guerilla. L'acteur évolue entre différents genres : le thriller avec La Méthode, le film historique avec Alatriste, le drame social avec Biutiful d’Alejandro González Iñárritu, et la comédie à sketches avec Les Hommes ! De quoi parlent-ils ?. En 2017, il est couronné d’un troisième Goya, cette fois pour son interprétation magistrale de l’agent secret Francisco Paesa dans L'Homme aux mille visages d'Alberto Rodríguez.

Le natif de Barcelone retrouve également Cesc Gay pour Truman (2015), Javier Bardem dans le thriller Everybody Knows (2018) d'Asghar Farhadi et Alejandro Amenábar pour le drame historique Lettre à Franco (2020). Décidément friand de thriller, il joue en 2022 dans Les Lignes courbes de Dieu, un film conçu pour la plateforme Netflix. En 2025, l’acteur incarne le rôle titre de Marco, l’énigme d’une vie, un biopic centré sur Enric Marco, le fondateur et le président de l’association des victimes espagnoles de l’Holocauste dont le passé de déporté est fortement remis en question.

À la télévision, il s’illustre également dans des séries à succès comme Crematorio, La Zona, D'une main de fer et la série fantastique 30 monedas réalisée par Álex de la Iglesia, où il démontre une nouvelle fois son aisance à naviguer entre drame et fantastique.

Laurent Schenck